台風１９号による大雨で長野市を流れる千曲川が氾濫したため、ＪＲ東日本は長野市赤沼の「長野新幹線車両センター」に留め置いていた北陸新幹線の１０編成、あわせて１２０車両で浸水被害を確認。
北陸新幹線は３０編成あるが、今回の浸水で全車両の３分の１が被害にあったということだ。
北陸・長野新幹線は台風の接近に伴い１２日午後から運休し、１３日午後から運行再開予定だった北陸新幹線「かがやき」「はくたか」はこの水没を受けて、１３日も終日運休となった。
ＪＲは、設備や車両の修繕に相当な時間がかかり、運休が長期化する可能性もあるとしている。
なお、富山、金沢間の「つるぎ」は運転される。